分子识别中蛋白质结构的信息处理研讨会

组织者:
Bhaskar DasGupta，伊利诺伊大学芝加哥分校，dasgupta@cs.uic.edu
梁杰，伊利诺伊大学芝加哥分校，jliang@uic.edu
由DIMACS/BioMaPS/MB中心特别关注生物学中的信息处理主办。
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细胞中的生物过程是基于特定的分子识别，这触发了级联的生物反应。复杂网络相互作用的物理基础是蛋白质及其功能区域的三维结构。了解这些生物分子中编码的信息如何被相互作用的伙伴识别和处理是生物学的一个基本问题。
在这项工作中，我们关注的是发现对识别很重要的空间模式的算法的发展，为揭示蛋白质的深层进化关系，预测结合伙伴，并为模拟蛋白质-蛋白质和蛋白质- dna识别过程。研究方向包括蛋白质配体和蛋白质结合位点的预测、已知结构但功能未知的蛋白质的功能预测、蛋白质相互作用和对接、免疫表位的预测、蛋白质相互作用的多肽调节剂的设计、蛋白质亚结构的匹配、以及结构生物模式的进化。我们希望在这些领域的进一步发展将可能形成新的研究问题，并在组合学、优化、离散数学、数学规划和其他领域激发新的算法。